【案例】

2019年6月，上海某环保设备有限公司（简称：上海环保公司），与自然人王某采购一批零配件，价税合计565万元。

王某提供了江西某贸易公司（简称：江西贸易公司）的增值税专用发票。

上海环保公司按票面金额、账号，通过银行支付款项。

2023年8月，江西贸易公司虚开发票案发，江西税务局稽查局发函上海稽查局，要求组织协查。

经查，上海市税务稽查局认定上海环保公司构成善意接受虚开，作出如下处理：

一、依据《关于纳税人善意取得虚开的增值税专用发票处理问题的通知》（国税发[2000]187号）规定，责令补缴增值税65万元。

二、依据《企业所得税税前扣除凭证管理办法》（国家税务总局公告2018年第28号）第十四条规定，责成换开发票。

【争议】

由于实际交易方是王某。王某是自然人，无法开具增值税专用发票，只能申请代开普通发票。因此，产生如下争议：

一、申请换开发票的金额是多少？是不含税的500万元，还是含税的565万元？

二、申请代开普票的征收率，是按2019年的3%，还是按2023年普遍适用的1%？

三、王某向税务机关申请代开中，如税务机关因金额较大而拒绝代开，上海环保公司怎么办？

【研究成果】

一、应按565万元的价税合计金额，由王某向经营地税务机关办理2019年6月的增值税补充申报，并申请代开征收率为3%的普通发票。

二、若因无法操作，税务机关拒绝代开，则上海环保公司可以其他相关凭证，据实进行所得税税前列支。

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